Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XPR1Q9UBH6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms