Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRR3Q9UBC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms