Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B7

CFAP97, Cilia- and flagella-associated protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP97Q9P2B7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP97Q9P2B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP97Q9P2B7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms