Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD1BQ9P298 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms