Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MBD5Q9P267 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms