Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRD1Q9P1U0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms