Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH2Q9P0N8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms