Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX1Q9NZR4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VSX1Q9NZR4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms