Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms