Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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