Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZE8

MRPL35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL35Q9NZE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL35Q9NZE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL35Q9NZE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms