Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms