Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF38Q9NXL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms