Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms