Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IFT57Q9NWB7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms