Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLE1Q9NVX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms