Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF3Q9NUQ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms