Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC39A9Q9NUM3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms