Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms