Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms