Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms