Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHPT1Q9NRX4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms