Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDHAF3Q9NRP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDHAF3Q9NRP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms