Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARHGEF3Q9NR81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms