Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM7Q9NQW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms