Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRTAC1Q9NQ79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRTAC1Q9NQ79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRTAC1Q9NQ79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms