Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms