Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZDHHC4Q9NPG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC4Q9NPG8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms