Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCB9Q9NP78 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCB9Q9NP78 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCB9Q9NP78 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms