Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRPEL1Q9HAV7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRPEL1Q9HAV7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRPEL1Q9HAV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms