Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF2Q9HAU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms