Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF2Q9HAK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF2Q9HAK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms