Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms