Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms