Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD3Q9H7E2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDRD3Q9H7E2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD3Q9H7E2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms