Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL3Q9H2J4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms