Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM117Q9H0C3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM117Q9H0C3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms