Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSP1Q9GZU7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms