Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1585.5 ms