Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF3Q9GZM5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms