Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2J2Q9GZM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms