Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC2Q9C0B9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms