Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms