Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPEB1Q9BZB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPEB1Q9BZB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms