Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL13Q9BYD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms