Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRXQ9BXM0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRXQ9BXM0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRXQ9BXM0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms