Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYCP2Q9BX26 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms