Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC2P3Q9BVR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC2P3Q9BVR0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms