Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms