Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM109Q9BVC6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms